About the service Об услуге Қызмет туралы
We perform PCR analysis in both classical and real-time formats. Conventional (endpoint) PCR with gel detection answers qualitative questions — whether a target sequence, gene, or pathogen is present in the sample. Real-time PCR (qPCR) with TaqMan probes or intercalating dyes adds precise quantification: pathogen load, copy number, the proportion of a target in a mixture, and gene-expression levels by RT-qPCR. Мы выполняем ПЦР-анализ в классическом формате и в режиме реального времени. Классическая ПЦР (по конечной точке) с детекцией в геле отвечает на качественные вопросы — присутствует ли в образце целевая последовательность, ген или патоген. ПЦР в реальном времени (qPCR) с зондами TaqMan или интеркалирующими красителями добавляет точную количественную оценку: нагрузка патогена, число копий, доля мишени в смеси и уровни экспрессии генов методом ОТ-ПЦР. Біз ПТР-талдауды классикалық форматта және нақты уақыт режимінде орындаймыз. Гельде детекцияланатын классикалық ПТР (соңғы нүкте бойынша) сапалық сұрақтарға жауап береді — үлгіде нысаналы тізбек, ген немесе патоген бар ма. TaqMan зондтары немесе интеркаляциялық бояғыштары бар нақты уақыттағы ПТР (qPCR) дәл сандық бағалауды қосады: патоген жүктемесі, көшірмелер саны, қоспадағы нысана үлесі және КТ-ПТР әдісімен ген экспрессиясының деңгейлері.
We work both with established assays — published or supplied by you — and with systems developed and validated in-house for your target. Every run includes appropriate positive, negative, and internal controls. Мы работаем как с готовыми тест-системами — опубликованными или предоставленными вами, — так и с системами, разработанными и валидированными нами под вашу мишень. Каждая постановка включает соответствующие положительные, отрицательные и внутренние контроли. Біз дайын тест-жүйелермен де — жарияланған немесе сіз ұсынған, — өз күшімізбен сіздің нысанаңызға арнап әзірленген және валидацияланған жүйелермен де жұмыс істейміз. Әр қойылым тиісті оң, теріс және ішкі бақылауларды қамтиды.
Primers and probes for the assay formats presented below are designed and synthesized within our Праймеры и зонды для представленных ниже форматов разрабатываются и синтезируются в рамках услуги Төменде ұсынылған форматтарға арналған праймерлер мен зондтар мына қызмет аясында жобаланып, синтезделеді: primers and probes service«Праймеры и зонды»«Праймерлер мен зондтар»; they can also be assembled into ready-to-use kits within их также можно укомплектовать в готовые наборы в сервисе оларды дайын жинақтарға да жинақтауға болады: diagnostic kit development«Разработка диагностических наборов»«Диагностикалық жинақтар әзірлеу».
Typical applications Типичные задачи Типтік тапсырмалар
- Detection of pathogens in plant, animal, clinical, and food samplesВыявление патогенов в растительных, животных, клинических и пищевых образцахӨсімдік, жануар, клиникалық және азық-түлік үлгілерінде патогендерді анықтау
- Confirmation of target genes and transgenesПодтверждение целевых генов и трансгеновНысаналы гендер мен трансгендерді растау
- Quantification of pathogen load and copy numberКоличественная оценка нагрузки патогена и числа копийПатоген жүктемесі мен көшірмелер санын сандық бағалау
- Gene-expression analysis by RT-qPCRАнализ экспрессии генов методом ОТ-ПЦР в реальном времениНақты уақыттағы КТ-ПТР әдісімен ген экспрессиясын талдау
- Screening of large sample series with multiplex assaysСкрининг больших серий образцов мультиплексными системамиҮлкен үлгі серияларын мультиплексті жүйелермен скринингтеу
- Verification of cloning, genotyping, and sequencing resultsПроверка результатов клонирования, генотипирования и секвенированияКлондау, генотиптеу және секвенирлеу нәтижелерін тексеру
PCR formats Форматы ПЦР-анализа ПТР-талдау форматтары
Conventional PCR Классическая ПЦР Классикалық ПТР
EndpointПо конечной точкеСоңғы нүктеQualitative detection of target sequences with electrophoretic analysis of products: presence/absence tests, amplification of fragments for cloning and sequencing, multiplex reactions for several targets at once, long-range PCR for extended templates. Качественная детекция целевых последовательностей с электрофоретическим анализом продуктов: тесты «есть/нет», наработка фрагментов для клонирования и секвенирования, мультиплексные реакции сразу на несколько мишеней, long-range ПЦР для протяжённых матриц. Өнімдерді электрофорездік талдаумен нысаналы тізбектерді сапалық детекциялау: «бар/жоқ» тесттері, клондау мен секвенирлеуге арналған фрагменттерді өндіру, бірден бірнеше нысанаға мультиплексті реакциялар, ұзын матрицаларға long-range ПТР.
Real-time PCR (qPCR) ПЦР в реальном времени (qPCR) Нақты уақыттағы ПТР (qPCR)
TaqMan · SYBRQuantitative analysis with TaqMan probes and intercalating dyes: absolute quantification against standard curves, relative quantification, pathogen load, copy number, and the fraction of a target in mixed samples. Melting-curve analysis for specificity control. Количественный анализ с зондами TaqMan и интеркалирующими красителями: абсолютная количественная оценка по калибровочным кривым, относительная оценка, нагрузка патогена, число копий и доля мишени в смешанных образцах. Анализ кривых плавления для контроля специфичности. TaqMan зондтарымен және интеркаляциялық бояғыштармен сандық талдау: калибрлеу қисықтары бойынша абсолютті сандық бағалау, салыстырмалы бағалау, патоген жүктемесі, көшірмелер саны және аралас үлгілердегі нысана үлесі. Спецификалығын бақылау үшін балқу қисықтарын талдау.
RT-qPCR and gene expression ОТ-ПЦР и экспрессия генов КТ-ПТР және ген экспрессиясы
RNAReverse-transcription PCR for RNA targets and expression studies: cDNA synthesis, relative expression analysis with reference-gene normalization, comparison of treatments, tissues, and time points, detection of RNA viruses. ПЦР с обратной транскрипцией для РНК-мишеней и исследований экспрессии: синтез кДНК, анализ относительной экспрессии с нормализацией по референсным генам, сравнение обработок, тканей и временных точек, детекция РНК-вирусов. РНҚ-нысаналарға және экспрессияны зерттеуге арналған кері транскрипциялы ПТР: кДНҚ синтезі, референстік гендер бойынша нормализациямен салыстырмалы экспрессияны талдау, өңдеулерді, ұлпаларды және уақыт нүктелерін салыстыру, РНҚ-вирустарды анықтау.
Assay setup and optimization Постановка и оптимизация методик Әдістемелерді қою және оңтайландыру
TransferПереносТасымалдауAdaptation of published protocols to your samples and equipment, optimization of reaction conditions and controls, and transfer of the finished method to your laboratory. Primers and probes are designed and synthesized within our Адаптация опубликованных протоколов к вашим образцам и оборудованию, оптимизация условий реакции и контролей, передача готовой методики в вашу лабораторию. Праймеры и зонды разрабатываются и синтезируются в рамках услуги Жарияланған хаттамаларды сіздің үлгілеріңіз бен жабдығыңызға бейімдеу, реакция жағдайлары мен бақылауларды оңтайландыру, дайын әдістемені зертханаңызға тапсыру. Праймерлер мен зондтар мына қызмет аясында жобаланып, синтезделеді: primers and probes service«Праймеры и зонды»«Праймерлер мен зондтар».
Dual-labelled qPCR probes qPCR-зонды с двойной меткой Қос таңбалы qPCR зондтары
TaqMan · MGBTaqMan, MGB, and molecular-beacon probes for quantitative allelic discrimination — allele-specific pairs with matched melting temperatures and minimal cross-reactivity, including a multiplex mode. Зонды TaqMan, MGB и molecular beacon для количественной аллельной дискриминации — аллель-специфичные пары с согласованными температурами плавления и минимальной перекрёстной реактивностью, включая мультиплексный режим. Сандық аллельдік дискриминацияға арналған TaqMan, MGB және molecular beacon зондтары — балқу температуралары үйлестірілген, айқас реактивтілігі минималды аллель-спецификалық жұптар, мультиплексті режимді қоса.
SNaPshot
MinisequencingМинисеквенированиеМинисеквенирлеуSingle-base-extension primers for multiplex SNP and InDel genotyping by capillary electrophoresis. The same chemistry also supports BAC fingerprinting and CpG-methylation minisequencing. Праймеры однонуклеотидного удлинения для мультиплексного генотипирования SNP и инделов капиллярным электрофорезом. Та же химия поддерживает BAC-фингерпринтинг и минисеквенирование CpG-метилирования. Капиллярлық электрофорезбен SNP мен инделдерді мультиплексті генотиптеуге арналған бір негізді ұзарту праймерлері. Сол химия BAC-фингерпринтинг пен CpG-метилденуді минисеквенирлеуді де қолдайды.
MLPA / digitalMLPA
LPO + RPOLigation-dependent half-probe pairs (LPO + RPO) with stuffer sequences and universal tags for copy-number, SNP, and InDel detection by capillary electrophoresis — or, for panels of up to 1000 targets, by sequencing (digitalMLPA). Лигазозависимые пары полузондов (LPO + RPO) со стаффер-последовательностями и универсальными тегами для детекции числа копий, SNP и инделов капиллярным электрофорезом — или, для панелей до 1000 мишеней, секвенированием (digitalMLPA). Көшірмелер санын, SNP мен инделдерді капиллярлық электрофорезбен — немесе 1000-ға дейінгі нысана панельдері үшін секвенирлеумен (digitalMLPA) — анықтауға арналған стаффер-тізбектері мен әмбебап тегтері бар лигазаға тәуелді жартылай зонд жұптары (LPO + RPO).
STR/SSR fragment analysis Фрагментный анализ STR/SSR STR/SSR фрагменттік талдау
Universal tailsУниверсальные хвостыӘмбебап құйрықтарFlanking primers for microsatellite genotyping by capillary-electrophoresis fragment sizing — with economical universal-tail fluorescent labelling and automatic dye and size assignment in multiplexes. Фланкирующие праймеры для генотипирования микросателлитов по размерам фрагментов в капиллярном электрофорезе — с экономичным флуоресцентным мечением через универсальные «хвосты» и автоматическим распределением красителей и размеров в мультиплексах. Микросателлиттерді капиллярлық электрофорезде фрагмент өлшемдері бойынша генотиптеуге арналған фланктеуші праймерлер — әмбебап «құйрықтар» арқылы үнемді флуоресценттік таңбалау және мультиплекстерде бояғыштар мен өлшемдерді автоматты бөлу.
PCR · Multiplex · QF-PCR
Assay designДизайн системЖүйелер дизайныA general-purpose assay-design engine covering standard, inverse, multiplex, TaqMan/MGB-probe, bisulfite, and RPA formats. The quantitative-fluorescent (QF-PCR) mode generates STR-flanking primers for gene-dosage and copy-number analysis. Универсальный дизайн тест-систем: стандартный, инвертированный, мультиплексный, TaqMan/MGB-зондовый, бисульфитный и RPA-форматы. Количественно-флуоресцентный режим (QF-PCR) генерирует STR-фланкирующие праймеры для анализа дозы генов и числа копий. Тест-жүйелердің әмбебап дизайны: стандартты, инверсті, мультиплексті, TaqMan/MGB-зондты, бисульфиттік және RPA форматтары. Сандық-флуоресценттік режим (QF-PCR) ген дозасы мен көшірмелер санын талдауға арналған STR-фланктеуші праймерлерді жасайды.
TSDR toehold exchange probes TSDR: toehold-зонды TSDR: toehold зондтары
SNPToehold-mediated strand-displacement exchange probes for high-specificity SNP and allele discrimination: the probe is tuned to a near-thermoneutral reaction and scores single-base mismatches using measured nearest-neighbour thermodynamics. Toehold-зонды обменного вытеснения цепей для высокоспецифичной дискриминации SNP и аллелей: зонд настраивается на почти термонейтральную реакцию и различает однонуклеотидные несоответствия на основе измеренной термодинамики ближайших соседей. SNP мен аллельдерді жоғары спецификалықпен ажыратуға арналған toehold-медиацияланған тізбекті ығыстырып алмастыру зондтары: зонд термобейтарапқа жуық реакцияға бапталады және бір негізді сәйкессіздіктерді жақын көршілер термодинамикасының өлшенген мәндері негізінде ажыратады.
What you receive Что вы получаете Сіз не аласыз
- Result tables: presence/absence calls, Ct values, calculated quantitiesТаблицы результатов: качественные заключения, значения Ct, рассчитанные количестваНәтижелер кестелері: сапалық қорытындылар, Ct мәндері, есептелген мөлшерлер
- Primary data: gel images, amplification and melting curvesПервичные данные: изображения гелей, кривые амплификации и плавленияБастапқы деректер: гель суреттері, амплификация және балқу қисықтары
- Interpretation with controls documented for every runИнтерпретация результатов с документированными контролями каждой постановкиӘр қойылымның құжатталған бақылауларымен нәтижелерді түсіндіру
- A written report ready for use in projects, theses, and publicationsПисьменный отчёт, готовый для использования в проектах, диссертациях и публикацияхЖобаларда, диссертацияларда және жарияланымдарда қолдануға дайын жазбаша есеп
Starting material Исходный материал Бастапқы материал
We accept purified DNA and RNA as well as raw material — plant and animal tissues, blood, food products, environmental samples. If you start from raw material, extraction and quality control are performed as part of our Мы принимаем как очищенные ДНК и РНК, так и исходный материал — растительные и животные ткани, кровь, пищевые продукты, образцы из окружающей среды. Если вы предоставляете исходный материал, выделение и контроль качества выполняются в рамках услуги Біз тазартылған ДНҚ мен РНҚ-ны да, бастапқы материалды да — өсімдік және жануар ұлпаларын, қанды, азық-түлік өнімдерін, қоршаған орта үлгілерін — қабылдаймыз. Бастапқы материал берсеңіз, бөліп алу мен сапа бақылауы мына қызмет аясында орындалады: DNA and RNA extraction service«Выделение ДНК и РНК»«ДНҚ және РНҚ бөліп алу».
Sample requirements (amount, storage, shipping) and the assay design are agreed individually for each project before the contract is signed. Требования к образцам (количество, хранение, доставка) и схема анализа согласовываются индивидуально для каждого проекта до заключения договора. Үлгілерге қойылатын талаптар (мөлшері, сақтау, жеткізу) мен талдау схемасы әр жоба үшін шарт жасалғанға дейін жеке келісіледі.
Order PCR analysis Заказать ПЦР-анализ ПТР-талдауға тапсырыс беру
Describe your target, material, and number of samples — we will choose the format (conventional or real-time), recommend the assay, and prepare a quote. Опишите мишень, материал и число образцов — мы подберём формат (классическая или в реальном времени), порекомендуем тест-систему и подготовим расчёт стоимости. Нысананы, материалды және үлгілер санын сипаттаңыз — біз форматты (классикалық немесе нақты уақыттағы) таңдап, тест-жүйені ұсынып, құн есебін дайындаймыз.