About the service Об услуге Қызмет туралы
We analyze ancient and historical DNA from archaeological remains, museum specimens, and herbarium collections. Degraded material demands its own discipline: dedicated workflows separated from modern DNA, contamination controls at every step, extraction protocols tuned for short fragments, and computational authentication that demonstrates the sequences are genuinely ancient rather than modern contamination. Мы анализируем древнюю и историческую ДНК из археологических останков, музейных экспонатов и гербарных коллекций. Деградированный материал требует особой дисциплины: выделенные рабочие потоки, отделённые от современной ДНК, контроль контаминации на каждом этапе, протоколы выделения, настроенные на короткие фрагменты, и вычислительная аутентификация, доказывающая, что последовательности действительно древние, а не современное загрязнение. Біз археологиялық қалдықтардан, мұражай экспонаттарынан және гербарий коллекцияларынан ежелгі және тарихи ДНҚ-ны талдаймыз. Деградацияланған материал ерекше тәртіпті талап етеді: қазіргі ДНҚ-дан бөлінген арнайы жұмыс ағындары, әр кезеңде контаминацияны бақылау, қысқа фрагменттерге бапталған бөліп алу хаттамалары және тізбектердің қазіргі ластану емес, шын мәнінде ежелгі екенін дәлелдейтін есептеу аутентификациясы.
For Kazakhstan and Central Asia this opens a rich field: burial-ground archaeology, the history of livestock and crop domestication on the steppe, paleofauna, and the genetic study of museum and seed collections accumulated over decades. Для Казахстана и Центральной Азии это открывает богатое поле: археология курганов и могильников, история доместикации скота и сельскохозяйственных культур в степи, палеофауна и генетическое изучение музейных и семенных коллекций, накопленных десятилетиями. Қазақстан мен Орталық Азия үшін бұл бай өріс ашады: қорғандар мен зираттар археологиясы, далада мал мен ауыл шаруашылығы дақылдарының қолға үйретілу тарихы, палеофауна және ондаған жылдар бойы жинақталған мұражай мен тұқым коллекцияларын генетикалық зерттеу.
Typical applications Типичные задачи Типтік тапсырмалар
- Species identification of archaeological and paleontological remainsВидовая идентификация археологических и палеонтологических останковАрхеологиялық және палеонтологиялық қалдықтардың түрін сәйкестендіру
- Haplogroups and sex determination of ancient individualsГаплогруппы и определение пола древних индивидовЕжелгі индивидтердің гаплотоптары мен жынысын анықтау
- Kinship between individuals within burialsРодственные связи между индивидами в захороненияхЖерлеулердегі индивидтер арасындағы туыстық байланыстар
- Domestication history of livestock and cropsИстория доместикации скота и сельскохозяйственных культурМал мен ауыл шаруашылығы дақылдарының қолға үйретілу тарихы
- Genotyping of museum, herbarium, and old seed collectionsГенотипирование музейных, гербарных и старых семенных коллекцийМұражай, гербарий және ескі тұқым коллекцияларын генотиптеу
- Preservation assessment before committing valuable materialОценка сохранности ДНК до расходования ценного материалаҚұнды материалды жұмсамас бұрын ДНҚ сақталуын бағалау
From sample to authenticated result От образца до аутентифицированного результата Үлгіден аутентификацияланған нәтижеге дейін
Extraction from degraded material Выделение из деградированного материала Деградацияланған материалдан бөліп алу
Contamination controlКонтроль контаминацииКонтаминация бақылауыExtraction of ancient DNA from bones, teeth, herbarium sheets, and museum specimens using protocols optimized for short, damaged fragments: minimal-destructive sampling, negative controls at every step, and workflows physically separated from modern-DNA work. Выделение древней ДНК из костей, зубов, гербарных листов и музейных экспонатов по протоколам, оптимизированным для коротких повреждённых фрагментов: минимально разрушающий отбор, отрицательные контроли на каждом этапе и рабочие потоки, физически отделённые от работ с современной ДНК. Сүйектерден, тістерден, гербарий парақтарынан және мұражай экспонаттарынан ежелгі ДНҚ-ны қысқа, зақымдалған фрагменттерге оңтайландырылған хаттамалармен бөліп алу: минималды бұзатын іріктеу, әр кезеңде теріс бақылаулар және қазіргі ДНҚ жұмыстарынан физикалық бөлінген жұмыс ағындары.
Sequencing and authentication Секвенирование и аутентификация Секвенирлеу және аутентификация
Damage patternsПрофили поврежденийЗақымдану профильдеріLibrary preparation for highly fragmented DNA and a sequencing strategy matched to the preservation of each sample. Authenticity is demonstrated computationally: terminal deamination damage patterns, fragment-length distributions, and contamination estimates accompany every dataset. Подготовка библиотек для сильно фрагментированной ДНК и стратегия секвенирования, подобранная под сохранность каждого образца. Подлинность доказывается вычислительно: профили дезаминирования на концах фрагментов, распределения длин фрагментов и оценки контаминации сопровождают каждый набор данных. Қатты фрагменттелген ДНҚ үшін кітапханалар дайындау және әр үлгінің сақталуына сай таңдалған секвенирлеу стратегиясы. Түпнұсқалық есептеу жолымен дәлелденеді: фрагмент ұштарындағы дезаминдену профильдері, фрагмент ұзындықтарының таралуы және контаминация бағалары әр деректер жинағымен бірге беріледі.
Population and kinship analysis Популяционный и родственный анализ Популяциялық және туыстық талдау
mtDNA · YGenetic sex determination, mitochondrial and Y-chromosome haplogroup assignment, kinship estimation between individuals from the same site, and population-affinity analysis against published ancient and modern reference panels. Генетическое определение пола, отнесение к митохондриальным и Y-хромосомным гаплогруппам, оценка родства между индивидами одного памятника и анализ популяционных связей по опубликованным древним и современным референсным панелям. Жынысты генетикалық анықтау, митохондриялық және Y-хромосомалық гаплотоптарға жатқызу, бір ескерткіштің индивидтері арасындағы туыстықты бағалау және жарияланған ежелгі әрі қазіргі референстік панельдер бойынша популяциялық байланыстарды талдау.
Collections and project planning Коллекции и планирование проектов Коллекциялар және жобаларды жоспарлау
Pilot studiesПилотные исследованияПилоттық зерттеулерScreening of collections before large projects: preservation assessment on a subset of samples, prioritization of material worth sequencing, and joint planning with archaeologists and curators — so irreplaceable specimens are spent on the questions they can actually answer. Скрининг коллекций перед крупными проектами: оценка сохранности на подвыборке образцов, приоритизация материала, который стоит секвенировать, и совместное планирование с археологами и хранителями — чтобы невосполнимые экспонаты расходовались на вопросы, на которые они действительно могут ответить. Ірі жобалар алдында коллекцияларды скринингтеу: үлгілердің ішінара таңдамасында сақталуын бағалау, секвенирлеуге тұрарлық материалды басымдықтау және археологтармен, қор сақтаушылармен бірлесіп жоспарлау — орны толмас экспонаттар шынымен жауап бере алатын сұрақтарға жұмсалуы үшін.
What you receive Что вы получаете Сіз не аласыз
- Raw sequencing data (FASTQ) and processed alignmentsПервичные данные секвенирования (FASTQ) и обработанные выравниванияБастапқы секвенирлеу деректері (FASTQ) және өңделген туралаулар
- Authentication report: damage profiles, fragment lengths, contamination estimatesОтчёт об аутентификации: профили повреждений, длины фрагментов, оценки контаминацииАутентификация есебі: зақымдану профильдері, фрагмент ұзындықтары, контаминация бағалары
- Result tables: species, sex, haplogroups, kinship coefficientsТаблицы результатов: вид, пол, гаплогруппы, коэффициенты родстваНәтижелер кестелері: түрі, жынысы, гаплотоптары, туыстық коэффициенттері
- A written report ready for archaeological publications and interdisciplinary projectsПисьменный отчёт, готовый для археологических публикаций и междисциплинарных проектовАрхеологиялық жарияланымдар мен пәнаралық жобаларға дайын жазбаша есеп
Working with irreplaceable material Работа с невосполнимым материалом Орны толмас материалмен жұмыс
Sampling amounts and locations are agreed with curators and archaeologists in advance; whenever possible we use minimal-destructive methods and return unused material. Work with human remains is carried out within the excavation permits and ethical approvals held by the customer, with respect for the cultural context of the finds. Объёмы и места отбора согласовываются с хранителями и археологами заранее; где возможно, используются минимально разрушающие методы, а неизрасходованный материал возвращается. Работы с человеческими останками ведутся в рамках разрешений на раскопки и этических одобрений, имеющихся у заказчика, с уважением к культурному контексту находок. Іріктеу мөлшері мен орындары қор сақтаушылармен және археологтармен алдын ала келісіледі; мүмкіндігінше минималды бұзатын әдістер қолданылып, жұмсалмаған материал қайтарылады. Адам қалдықтарымен жұмыс тапсырыс берушідегі қазба рұқсаттары мен этикалық мақұлдаулар аясында, олжалардың мәдени контексіне құрметпен жүргізіледі.
Remaining extracts and collection samples can be preserved for future studies through our Оставшиеся экстракты и коллекционные образцы можно сохранить для будущих исследований через услугу Қалған экстрактілер мен коллекциялық үлгілерді болашақ зерттеулер үшін мына қызмет арқылы сақтауға болады: biobanking service«Биобанкирование»«Биобанкілеу». Scope and timelines are agreed before the contract is signed. Объём работ и сроки согласовываются до заключения договора. Жұмыс көлемі мен мерзімдер шарт жасалғанға дейін келісіледі.
Order ancient DNA analysis Заказать анализ древней ДНК Ежелгі ДНҚ талдауына тапсырыс беру
Describe the material, its age and context, and the question — species, kinship, haplogroups, or population history — and we will assess feasibility and prepare a quote. Опишите материал, его возраст и контекст, а также вопрос — вид, родство, гаплогруппы или популяционная история, — мы оценим выполнимость и подготовим расчёт стоимости. Материалды, оның жасы мен контексін және сұрақты — түрі, туыстығы, гаплотоптары немесе популяциялық тарихы — сипаттаңыз, біз орындалу мүмкіндігін бағалап, құн есебін дайындаймыз.