About the service Об услуге Қызмет туралы
We cover the full oligonucleotide cycle: in-silico design of primers and probes for your target, synthesis — including modified oligos with fluorophores and quenchers — and empirical testing of the finished assay on real samples. You can order any single stage or the complete package: from a target sequence to a working, validated primer system with a written protocol. Мы закрываем полный цикл работ с олигонуклеотидами: дизайн праймеров и зондов in silico под вашу мишень, синтез — включая модифицированные олигонуклеотиды с флуорофорами и гасителями — и экспериментальное тестирование готовой системы на реальных образцах. Можно заказать любой отдельный этап или полный пакет: от целевой последовательности до работающей валидированной праймерной системы с готовым протоколом. Біз олигонуклеотидтермен жұмыстың толық циклін қамтимыз: сіздің нысанаңызға арнап праймерлер мен зондтарды in silico жобалау, синтез — флуорофорлар мен өшіргіштері бар модификацияланған олигонуклеотидтерді қоса — және дайын жүйені нақты үлгілерде эксперименттік тестілеу. Кез келген жеке кезеңге немесе толық пакетке тапсырыс беруге болады: нысаналы тізбектен дайын хаттамасы бар жұмыс істейтін валидацияланған праймерлік жүйеге дейін.
Designs are prepared for all common assay formats — conventional PCR, real-time PCR with TaqMan probes, KASP and other allele-specific systems, sequencing, and multiplex panels — with specificity checked against target and off-target genomes. Дизайн выполняется для всех распространённых форматов — классической ПЦР, ПЦР в реальном времени с зондами TaqMan, KASP и других аллель-специфичных систем, секвенирования и мультиплексных панелей — с проверкой специфичности по целевым и нецелевым геномам. Жобалау барлық кең таралған форматтар үшін орындалады — классикалық ПТР, TaqMan зондтары бар нақты уақыттағы ПТР, KASP және басқа аллель-спецификалық жүйелер, секвенирлеу және мультиплексті панельдер — спецификалығы нысаналы және нысаналы емес геномдар бойынша тексеріледі.
The specialized probe and primer formats presented below are also offered as ready genotyping assays — see the Представленные ниже специализированные форматы зондов и праймеров доступны и как готовые анализы генотипирования — см. сервис Төменде ұсынылған зондтар мен праймерлердің мамандандырылған форматтары дайын генотиптеу талдаулары ретінде де қолжетімді — қараңыз: genotyping service«Генотипирование»«Генотиптеу».
Typical applications Типичные задачи Типтік тапсырмалар
- Primers for routine PCR, qPCR, and sequencingПраймеры для рутинной ПЦР, кПЦР и секвенированияКүнделікті ПТР, кПТР және секвенирлеуге арналған праймерлер
- TaqMan probes for quantitative and diagnostic assaysЗонды TaqMan для количественных и диагностических тестовСандық және диагностикалық тесттерге арналған TaqMan зондтары
- Allele-specific assays (KASP and others) for SNP genotypingАллель-специфичные системы (KASP и другие) для SNP-генотипированияSNP-генотиптеуге арналған аллель-спецификалық жүйелер (KASP және басқалары)
- Species- and pathogen-specific detection systemsВидо- и патоген-специфичные системы детекцииТүрге және патогенге тән детекция жүйелері
- Multiplex panels with balanced primer setsМультиплексные панели со сбалансированными наборами праймеровТеңгерімделген праймер жиынтықтары бар мультиплексті панельдер
- Synthesis of published primer sets and their adaptation to your equipmentСинтез опубликованных праймерных наборов и их адаптация к вашему оборудованиюЖарияланған праймер жиынтықтарын синтездеу және жабдығыңызға бейімдеу
From design to a validated assay От дизайна до валидированной системы Жобалаудан валидацияланған жүйеге дейін
Primer and probe design Дизайн праймеров и зондов Праймерлер мен зондтарды жобалау
In silicoTarget selection and in-silico design: melting temperature and GC balance, secondary-structure and primer-dimer analysis, specificity screening against target and related genomes, compatibility planning for multiplex reactions. Выбор мишени и дизайн in silico: температура плавления и GC-баланс, анализ вторичных структур и праймер-димеров, проверка специфичности по целевым и родственным геномам, планирование совместимости для мультиплексных реакций. Нысананы таңдау және in silico жобалау: балқу температурасы мен GC-балансы, қайталама құрылымдар мен праймер-димерлерді талдау, нысаналы және туыстас геномдар бойынша спецификалығын тексеру, мультиплексті реакцияларға үйлесімділікті жоспарлау.
Oligonucleotide synthesis Синтез олигонуклеотидов Олигонуклеотидтер синтезі
ModificationsМодификацииМодификацияларSynthesis of standard primers and modified oligonucleotides: fluorophores and quenchers for TaqMan probes (FAM, HEX, ROX, Cy5, BHQ and others), tails and adapters for genotyping formats. Scale and purification (desalting, HPLC) are chosen to fit the application. Синтез стандартных праймеров и модифицированных олигонуклеотидов: флуорофоры и гасители для зондов TaqMan (FAM, HEX, ROX, Cy5, BHQ и другие), хвосты и адаптеры для генотипирующих форматов. Масштаб и очистка (обессоливание, ВЭЖХ) подбираются под задачу. Стандартты праймерлер мен модификацияланған олигонуклеотидтерді синтездеу: TaqMan зондтарына арналған флуорофорлар мен өшіргіштер (FAM, HEX, ROX, Cy5, BHQ және басқалары), генотиптеу форматтарына арналған құйрықтар мен адаптерлер. Ауқымы мен тазартуы (тұзсыздандыру, ВЭЖХ) тапсырмаға сай таңдалады.
Testing and validation Тестирование и валидация Тестілеу және валидация
Real samplesРеальные образцыНақты үлгілерEmpirical verification of the designed assay: annealing-temperature optimization (gradient PCR), amplification-efficiency curves for qPCR, specificity checks on positive and negative controls, balancing of multiplex reactions. Экспериментальная проверка разработанной системы: оптимизация температуры отжига (градиентная ПЦР), кривые эффективности амплификации для кПЦР, проверка специфичности на положительных и отрицательных контролях, балансировка мультиплексных реакций. Әзірленген жүйені эксперименттік тексеру: жабысу температурасын оңтайландыру (градиенттік ПТР), кПТР үшін амплификация тиімділігінің қисықтары, оң және теріс бақылауларда спецификалығын тексеру, мультиплексті реакцияларды теңгерімдеу.
Ready-to-use format Готовый формат Дайын формат
Protocol includedС протоколомХаттамасыменOligos are delivered normalized and ready for work, together with the recommended protocol (annealing temperature, concentrations, cycling program). A tested primer system can be assembled into a complete kit with buffer within our Олигонуклеотиды передаются нормализованными и готовыми к работе, вместе с рекомендованным протоколом (температура отжига, концентрации, программа циклирования). Протестированную праймерную систему можно укомплектовать в полный набор с буфером в рамках услуги Олигонуклеотидтер нормализацияланған және жұмысқа дайын күйде, ұсынылған хаттамамен бірге (жабысу температурасы, концентрациялар, циклдеу бағдарламасы) беріледі. Тестіленген праймерлік жүйені буферімен толық жинаққа мына қызмет аясында жинақтауға болады: diagnostic kit development service«Разработка диагностических наборов»«Диагностикалық жинақтар әзірлеу».
Dual-labelled qPCR probes qPCR-зонды с двойной меткой Қос таңбалы qPCR зондтары
TaqMan · MGBTaqMan, MGB, and molecular-beacon probes for quantitative allelic discrimination — allele-specific pairs with matched melting temperatures and minimal cross-reactivity, including a multiplex mode. Зонды TaqMan, MGB и molecular beacon для количественной аллельной дискриминации — аллель-специфичные пары с согласованными температурами плавления и минимальной перекрёстной реактивностью, включая мультиплексный режим. Сандық аллельдік дискриминацияға арналған TaqMan, MGB және molecular beacon зондтары — балқу температуралары үйлестірілген, айқас реактивтілігі минималды аллель-спецификалық жұптар, мультиплексті режимді қоса.
SNaPshot
MinisequencingМинисеквенированиеМинисеквенирлеуSingle-base-extension primers for multiplex SNP and InDel genotyping by capillary electrophoresis. The same chemistry also supports BAC fingerprinting and CpG-methylation minisequencing. Праймеры однонуклеотидного удлинения для мультиплексного генотипирования SNP и инделов капиллярным электрофорезом. Та же химия поддерживает BAC-фингерпринтинг и минисеквенирование CpG-метилирования. Капиллярлық электрофорезбен SNP мен инделдерді мультиплексті генотиптеуге арналған бір негізді ұзарту праймерлері. Сол химия BAC-фингерпринтинг пен CpG-метилденуді минисеквенирлеуді де қолдайды.
MLPA / digitalMLPA
LPO + RPOLigation-dependent half-probe pairs (LPO + RPO) with stuffer sequences and universal tags for copy-number, SNP, and InDel detection by capillary electrophoresis — or, for panels of up to 1000 targets, by sequencing (digitalMLPA). Лигазозависимые пары полузондов (LPO + RPO) со стаффер-последовательностями и универсальными тегами для детекции числа копий, SNP и инделов капиллярным электрофорезом — или, для панелей до 1000 мишеней, секвенированием (digitalMLPA). Көшірмелер санын, SNP мен инделдерді капиллярлық электрофорезбен — немесе 1000-ға дейінгі нысана панельдері үшін секвенирлеумен (digitalMLPA) — анықтауға арналған стаффер-тізбектері мен әмбебап тегтері бар лигазаға тәуелді жартылай зонд жұптары (LPO + RPO).
STR/SSR fragment analysis Фрагментный анализ STR/SSR STR/SSR фрагменттік талдау
Universal tailsУниверсальные хвостыӘмбебап құйрықтарFlanking primers for microsatellite genotyping by capillary-electrophoresis fragment sizing — with economical universal-tail fluorescent labelling and automatic dye and size assignment in multiplexes. Фланкирующие праймеры для генотипирования микросателлитов по размерам фрагментов в капиллярном электрофорезе — с экономичным флуоресцентным мечением через универсальные «хвосты» и автоматическим распределением красителей и размеров в мультиплексах. Микросателлиттерді капиллярлық электрофорезде фрагмент өлшемдері бойынша генотиптеуге арналған фланктеуші праймерлер — әмбебап «құйрықтар» арқылы үнемді флуоресценттік таңбалау және мультиплекстерде бояғыштар мен өлшемдерді автоматты бөлу.
PCR · Multiplex · QF-PCR
Assay designДизайн системЖүйелер дизайныA general-purpose assay-design engine covering standard, inverse, multiplex, TaqMan/MGB-probe, bisulfite, and RPA formats. The quantitative-fluorescent (QF-PCR) mode generates STR-flanking primers for gene-dosage and copy-number analysis. Универсальный дизайн тест-систем: стандартный, инвертированный, мультиплексный, TaqMan/MGB-зондовый, бисульфитный и RPA-форматы. Количественно-флуоресцентный режим (QF-PCR) генерирует STR-фланкирующие праймеры для анализа дозы генов и числа копий. Тест-жүйелердің әмбебап дизайны: стандартты, инверсті, мультиплексті, TaqMan/MGB-зондты, бисульфиттік және RPA форматтары. Сандық-флуоресценттік режим (QF-PCR) ген дозасы мен көшірмелер санын талдауға арналған STR-фланктеуші праймерлерді жасайды.
TSDR toehold exchange probes TSDR: toehold-зонды TSDR: toehold зондтары
SNPToehold-mediated strand-displacement exchange probes for high-specificity SNP and allele discrimination: the probe is tuned to a near-thermoneutral reaction and scores single-base mismatches using measured nearest-neighbour thermodynamics. Toehold-зонды обменного вытеснения цепей для высокоспецифичной дискриминации SNP и аллелей: зонд настраивается на почти термонейтральную реакцию и различает однонуклеотидные несоответствия на основе измеренной термодинамики ближайших соседей. SNP мен аллельдерді жоғары спецификалықпен ажыратуға арналған toehold-медиацияланған тізбекті ығыстырып алмастыру зондтары: зонд термобейтарапқа жуық реакцияға бапталады және бір негізді сәйкессіздіктерді жақын көршілер термодинамикасының өлшенген мәндері негізінде ажыратады.
What you receive Что вы получаете Сіз не аласыз
- Synthesized oligonucleotides in the agreed format (lyophilized or in solution, normalized)Синтезированные олигонуклеотиды в согласованном формате (лиофилизированные или в растворе, нормализованные)Келісілген форматтағы синтезделген олигонуклеотидтер (лиофилизацияланған немесе ерітіндіде, нормализацияланған)
- Design report: sequences, in-silico parameters, specificity-check resultsОтчёт о дизайне: последовательности, параметры in silico, результаты проверки специфичностиЖобалау есебі: тізбектер, in silico параметрлері, спецификалығын тексеру нәтижелері
- Validation data: gel images, amplification and efficiency curvesДанные валидации: изображения гелей, кривые амплификации и эффективностиВалидация деректері: гель суреттері, амплификация және тиімділік қисықтары
- A working protocol ready for routine use in your laboratoryРабочий протокол, готовый для рутинного использования в вашей лабораторииЗертханаңызда күнделікті қолдануға дайын жұмыс хаттамасы
What we need from you Что нужно от вас Сізден не қажет
For design: the target sequence or the gene/organism name, the assay format (PCR, qPCR, KASP, sequencing), and your instrument. For synthesis only: ready sequences with required modifications. For testing: control samples, or DNA prepared as part of our Для дизайна: целевая последовательность или название гена/организма, формат системы (ПЦР, кПЦР, KASP, секвенирование) и ваше оборудование. Только для синтеза: готовые последовательности с нужными модификациями. Для тестирования: контрольные образцы либо ДНК, подготовленная в рамках услуги Жобалау үшін: нысаналы тізбек немесе ген/организм атауы, жүйе форматы (ПТР, кПТР, KASP, секвенирлеу) және жабдығыңыз. Тек синтез үшін: қажетті модификациялары бар дайын тізбектер. Тестілеу үшін: бақылау үлгілері немесе мына қызмет аясында дайындалған ДНҚ: DNA and RNA extraction service«Выделение ДНК и РНК»«ДНҚ және РНҚ бөліп алу».
Scales, modifications, purification level, and delivery terms are agreed individually for each order before the contract is signed. Масштабы, модификации, степень очистки и условия поставки согласовываются индивидуально для каждого заказа до заключения договора. Ауқымы, модификациялары, тазарту дәрежесі және жеткізу шарттары әр тапсырыс үшін шарт жасалғанға дейін жеке келісіледі.
Order primers and probes Заказать праймеры и зонды Праймерлер мен зондтарға тапсырыс беру
Describe your target, assay format, and the number of oligos — we will propose the design, synthesis scale, and prepare a quote. Опишите мишень, формат системы и количество олигонуклеотидов — мы предложим дизайн, масштаб синтеза и подготовим расчёт стоимости. Нысананы, жүйе форматын және олигонуклеотидтер санын сипаттаңыз — біз дизайнды, синтез ауқымын ұсынып, құн есебін дайындаймыз.