About the service Об услуге Қызмет туралы
Metabolomics reads the chemical state of an organism: hundreds of small molecules — sugars, amino and organic acids, lipids, secondary metabolites — measured in one experiment. We run both discovery mode, where untargeted GC-MS and LC-MS profiling finds what differs between your groups, and targeted mode, where defined metabolite panels are quantified against standards. The metabolome responds to genotype, stress, diet, and environment within minutes, which makes it the most sensitive of the omics layers — and the most demanding of correct sampling. Метаболомика читает химическое состояние организма: сотни малых молекул — сахара, амино- и органические кислоты, липиды, вторичные метаболиты — измеряются в одном эксперименте. Мы работаем в двух режимах: поисковом, где нецелевое профилирование GC-MS и LC-MS находит различия между вашими группами, и целевом, где заданные панели метаболитов количественно определяются по стандартам. Метаболом отвечает на генотип, стресс, рацион и среду за минуты — это делает его самым чувствительным из омиксных уровней и самым требовательным к правильному отбору проб. Метаболомика организмнің химиялық күйін оқиды: жүздеген шағын молекулалар — қанттар, амин және органикалық қышқылдар, липидтер, қайталама метаболиттер — бір экспериментте өлшенеді. Біз екі режимде жұмыс істейміз: іздеу режимінде мақсатсыз GC-MS және LC-MS профильдеу топтарыңыз арасындағы айырмашылықтарды табады, ал нысаналы режимде белгіленген метаболит панельдері стандарттар бойынша сандық анықталады. Метаболом генотипке, стреске, рационға және ортаға минуттар ішінде жауап береді — бұл оны омикс деңгейлерінің ең сезімталы және үлгі іріктеуге ең талапшылы етеді.
Projects therefore start with design: comparison groups, replicates, quenching, and shipping are agreed before the first sample is taken, and end with statistics and pathway-level interpretation ready for a publication or report. Поэтому проекты начинаются с дизайна: группы сравнения, повторности, остановка метаболизма и доставка согласовываются до отбора первой пробы, — а заканчиваются статистикой и интерпретацией на уровне метаболических путей, готовой для публикации или отчёта. Сондықтан жобалар дизайннан басталады: салыстыру топтары, қайталанулар, метаболизмді тоқтату және жеткізу алғашқы үлгі алынғанға дейін келісіледі, — және жарияланымға немесе есепке дайын статистикамен әрі метаболизм жолдары деңгейіндегі интерпретациямен аяқталады.
Typical applications Типичные задачи Типтік тапсырмалар
- Metabolic differences between genotypes and treatments in cropsМетаболические различия между генотипами и обработками у культурДақылдардағы генотиптер мен өңдеулер арасындағы метаболизмдік айырмашылықтар
- Stress responses and quality traits in plants and animalsСтрессовые ответы и признаки качества у растений и животныхӨсімдіктер мен жануарлардағы стрестік жауаптар және сапа белгілері
- Secondary metabolites of medicinal and aromatic plantsВторичные метаболиты лекарственных и ароматических растенийДәрілік және хош иісті өсімдіктердің қайталама метаболиттері
- Food quality, authenticity, and fermentation monitoringКачество и аутентичность продуктов, мониторинг ферментацийӨнімдердің сапасы мен түпнұсқалығы, ферментацияларды мониторингтеу
- Microbial metabolites and culture media optimizationМикробные метаболиты и оптимизация питательных средМикробтық метаболиттер және қоректік орталарды оңтайландыру
- Research biomarker discovery in biofluidsИсследовательский поиск биомаркеров в биологических жидкостяхБиологиялық сұйықтықтарда биомаркерлерді зерттеу мақсатында іздеу
Approaches to metabolomics Подходы метаболомики Метаболомика тәсілдері
Untargeted profiling Нецелевое профилирование Мақсатсыз профильдеу
GC-MS · LC-MSBroad metabolite fingerprints without a predefined target list: hundreds of compounds detected per sample, annotation against spectral libraries, and discovery of the metabolites that actually separate your groups — the entry point when the question is «what changed?». Широкие метаболитные профили без заранее заданного списка мишеней: сотни соединений на образец, аннотация по спектральным библиотекам и поиск метаболитов, которые действительно разделяют ваши группы, — отправная точка, когда вопрос звучит как «что изменилось?». Алдын ала белгіленген нысана тізімінсіз кең метаболиттік профильдер: әр үлгіде жүздеген қосылыс, спектрлік кітапханалар бойынша аннотациялау және топтарыңызды шын мәнінде ажырататын метаболиттерді іздеу — сұрақ «не өзгерді?» болғандағы бастапқы нүкте.
Targeted analysis Целевой анализ Нысаналы талдау
QuantitativeКоличественныйСандықQuantification of defined metabolite panels — amino acids, organic acids, sugars, fatty acids, phenolic compounds — against authentic standards and calibration curves: absolute concentrations suitable for comparisons between studies, quality specifications, and validation of untargeted findings. Количественное определение заданных панелей метаболитов — аминокислот, органических кислот, сахаров, жирных кислот, фенольных соединений — по аутентичным стандартам и калибровочным кривым: абсолютные концентрации, пригодные для сравнений между исследованиями, спецификаций качества и валидации нецелевых находок. Белгіленген метаболит панельдерін — амин қышқылдарын, органикалық қышқылдарды, қанттарды, май қышқылдарын, фенолдық қосылыстарды — түпнұсқа стандарттар мен калибрлеу қисықтары бойынша сандық анықтау: зерттеулер арасындағы салыстыруларға, сапа спецификацияларына және мақсатсыз нәтижелерді валидациялауға жарамды абсолютті концентрациялар.
Sample preparation Пробоподготовка Үлгі дайындау
QuenchingОстановка метаболизмаМетаболизмді тоқтатуExtraction protocols matched to the matrix — plant tissues, biofluids, microbial cultures, food — with rapid quenching of metabolism, derivatization for GC-MS where needed, and quality-control samples throughout the batch so instrumental drift never masquerades as biology. Протоколы экстракции под конкретную матрицу — растительные ткани, биологические жидкости, микробные культуры, продукты — с быстрой остановкой метаболизма, дериватизацией для GC-MS при необходимости и контрольными образцами по всей серии, чтобы дрейф прибора не выдавал себя за биологию. Нақты матрицаға сай экстракция хаттамалары — өсімдік ұлпалары, биологиялық сұйықтықтар, микроб өсінділері, өнімдер — метаболизмді жылдам тоқтатумен, қажет болса GC-MS үшін дериваттаумен және аспап дрейфі биология болып көрінбеуі үшін бүкіл серия бойынша бақылау үлгілерімен.
Data analysis and pathways Анализ данных и метаболические пути Деректерді талдау және метаболизм жолдары
PCA · KEGGPeak processing, normalization, and multivariate statistics (PCA, PLS-DA), mapping of altered metabolites onto KEGG pathways, and — in multi-omics projects — integration with expression and protein data from our Обработка пиков, нормализация и многомерная статистика (PCA, PLS-DA), наложение изменённых метаболитов на пути KEGG, а в мультиомиксных проектах — интеграция с данными экспрессии и белков в рамках услуг Пиктерді өңдеу, нормализациялау және көпөлшемді статистика (PCA, PLS-DA), өзгерген метаболиттерді KEGG жолдарына түсіру, ал мультиомикс жобаларында — мына қызметтер аясында экспрессия және ақуыз деректерімен біріктіру: data analysis«Анализ данных»«Деректерді талдау» andижәне proteins and antibodies«Белки и антитела»«Ақуыздар және антиденелер» services.
What you receive Что вы получаете Сіз не аласыз
- Metabolite tables: annotated compounds with intensities or absolute concentrationsТаблицы метаболитов: аннотированные соединения с интенсивностями или абсолютными концентрациямиМетаболиттер кестелері: интенсивтіліктері немесе абсолютті концентрациялары бар аннотацияланған қосылыстар
- Statistical results: group separations, significant metabolites, quality-control metricsСтатистические результаты: разделение групп, значимые метаболиты, метрики контроля качестваСтатистикалық нәтижелер: топтардың бөлінуі, маңызды метаболиттер, сапа бақылауының көрсеткіштері
- Pathway maps and publication-quality figuresКарты метаболических путей и иллюстрации публикационного качестваМетаболизм жолдарының карталары және жарияланымдық сападағы суреттер
- A written report with methods described for the Methods sectionПисьменный отчёт с описанием методов, готовым для раздела MethodsMethods бөліміне дайын әдістер сипаттамасы бар жазбаша есеп
Starting material Исходный материал Бастапқы материал
The metabolome changes within minutes of sampling, so material must be frozen or stabilized immediately and shipped frozen — we provide sampling instructions for each matrix before the experiment. We accept plant and animal tissues, biofluids (plasma, serum, urine), microbial cultures, and food products; long-term storage of sample series is available through our Метаболом меняется в течение минут после отбора, поэтому материал должен быть немедленно заморожен или стабилизирован и доставлен замороженным — инструкции по отбору для каждой матрицы мы выдаём до начала эксперимента. Принимаем растительные и животные ткани, биологические жидкости (плазма, сыворотка, моча), микробные культуры и пищевые продукты; долгосрочное хранение серий образцов доступно через услугу Метаболом іріктеуден кейін минуттар ішінде өзгереді, сондықтан материал дереу мұздатылуы немесе тұрақтандырылуы және мұздатылған күйде жеткізілуі тиіс — әр матрица бойынша іріктеу нұсқаулықтарын эксперимент басталғанға дейін береміз. Өсімдік және жануар ұлпаларын, биологиялық сұйықтықтарды (плазма, сарысу, зәр), микроб өсінділерін және азық-түлік өнімдерін қабылдаймыз; үлгі серияларын ұзақ мерзімді сақтау мына қызмет арқылы қолжетімді: biobanking service«Биобанкирование»«Биобанкілеу».
Study design — groups, replicates, randomization, and batch layout — is agreed before sampling begins; medical biomarker studies are supported as research, not clinical diagnostics. Дизайн исследования — группы, повторности, рандомизация и раскладка серий — согласовывается до начала отбора; медицинские биомаркерные исследования выполняются как научные, а не как клиническая диагностика. Зерттеу дизайны — топтар, қайталанулар, рандомизация және серияларды орналастыру — іріктеу басталғанға дейін келісіледі; медициналық биомаркерлік зерттеулер клиникалық диагностика ретінде емес, ғылыми зерттеу ретінде орындалады.
Order metabolomics Заказать метаболомику Метаболомикаға тапсырыс беру
Describe the organism, matrix, comparison groups, and whether you need discovery profiling or a defined panel — we will propose the design and prepare a quote. Опишите организм, матрицу, группы сравнения и что требуется — поисковое профилирование или заданная панель, — мы предложим дизайн и подготовим расчёт стоимости. Организмді, матрицаны, салыстыру топтарын және нені қажет ететініңізді — іздеу профильдеуі ме, әлде белгіленген панель ме — сипаттаңыз, біз дизайнды ұсынып, құн есебін дайындаймыз.