About the service Об услуге Қызмет туралы
We provide statistical analysis and bioinformatics support for research data in medicine, plant and animal breeding, and veterinary science. A project is taken from raw data — including sequencer output — to publication-ready figures, tables, and substantiated conclusions; the methods are chosen to match the study design and the standards of your field. Мы выполняем статистический анализ и биоинформатическую обработку исследовательских данных в медицине, селекции растений и животных и ветеринарии. Проект ведётся от первичных данных — включая выходные файлы секвенаторов — до готовых к публикации рисунков, таблиц и обоснованных выводов; методы подбираются с учётом дизайна исследования и стандартов вашей области. Біз медицина, өсімдіктер мен жануарлар селекциясы және ветеринария саласындағы зерттеу деректеріне статистикалық талдау мен биоинформатикалық өңдеу жүргіземіз. Жоба бастапқы деректерден — соның ішінде секвенатор шығысындағы файлдардан — жарияланымға дайын суреттерге, кестелерге және негізделген қорытындыларға дейін жүргізіледі; әдістер зерттеу дизайны мен салаңыздың стандарттарына сай таңдалады.
Analysis is most effective when it is planned early: we also advise on experimental design before data collection — sample size, replication, randomization, and choice of controls — so that the data you collect can actually answer your question. All work is carried out under a formal contract. Анализ наиболее эффективен, когда он спланирован заранее: мы консультируем по дизайну эксперимента ещё до сбора данных — по объёму выборки, повторностям, рандомизации и выбору контролей, — чтобы полученные данные действительно позволяли ответить на поставленный вопрос. Работы выполняются по договору. Талдау алдын ала жоспарланғанда барынша тиімді болады: деректер жиналмай тұрып біз эксперимент дизайны бойынша кеңес береміз — іріктеме көлемі, қайталанулар, рандомизация және бақылау топтарын таңдау мәселелерінде, — осылайша жиналған деректер қойылған сұраққа нақты жауап бере алады. Жұмыстар шарт бойынша орындалады.
Typical tasks Типичные задачи Типтік тапсырмалар
- Biostatistics for medical and veterinary studiesБиостатистика для медицинских и ветеринарных исследованийМедициналық және ветеринариялық зерттеулерге арналған биостатистика
- Analysis of breeding trials and field experimentsАнализ селекционных испытаний и полевых опытовСелекциялық сынақтар мен далалық тәжірибелерді талдау
- Processing of Sanger and NGS sequencing dataОбработка данных секвенирования Sanger и NGSSanger және NGS секвенирлеу деректерін өңдеу
- Population-genetic and phylogenetic analysisПопуляционно-генетический и филогенетический анализПопуляциялық-генетикалық және филогенетикалық талдау
- Genotype data analysis: diversity, structure, marker-trait associationsАнализ данных генотипирования: разнообразие, структура, ассоциации «маркер — признак»Генотиптеу деректерін талдау: алуантүрлілік, құрылым, маркер мен белгі арасындағы ассоциациялар
- Preparation of figures and statistical sections for articlesПодготовка рисунков и статистических разделов для статейМақалаларға арналған суреттер мен статистикалық бөлімдерді дайындау
Areas of analysis Направления анализа Талдау бағыттары
StatisticsСтатистикаСтатистика
BiostatisticsБиостатистикаБиостатистикаDescriptive statistics, hypothesis testing, analysis of variance (ANOVA), regression, and multivariate methods (PCA, clustering, discriminant analysis). At the planning stage we calculate sample size and statistical power — before the first sample is collected. Описательная статистика, проверка гипотез, дисперсионный анализ (ANOVA), регрессионные и многомерные методы (PCA, кластеризация, дискриминантный анализ). На этапе планирования рассчитываем объём выборки и статистическую мощность — до сбора первого образца. Сипаттамалық статистика, гипотезаларды тексеру, дисперсиялық талдау (ANOVA), регрессиялық және көпөлшемді әдістер (PCA, кластерлеу, дискриминанттық талдау). Жоспарлау кезеңінде іріктеме көлемі мен статистикалық қуатты алғашқы үлгі жиналмай тұрып есептейміз.
BioinformaticsБиоинформатикаБиоинформатика
PipelinesПайплайныПайплайндарSequence assembly and annotation, read alignment, variant calling, phylogenetic reconstruction, and work with public sequence databases (NCBI, Ensembl). The tools and reproducible pipelines used are documented in the report. Сборка и аннотация последовательностей, выравнивание прочтений, поиск вариантов (variant calling), построение филогений и работа с публичными базами последовательностей (NCBI, Ensembl). Использованные инструменты и воспроизводимые пайплайны документируются в отчёте. Тізбектерді құрастыру және аннотациялау, оқылымдарды туралау, варианттарды анықтау (variant calling), филогенияларды құру және жалпыға қолжетімді тізбек базаларымен (NCBI, Ensembl) жұмыс. Қолданылған құралдар мен қайталанатын пайплайндар есепте құжатталады.
Sequencing dataДанные секвенированияСеквенирлеу деректері
Sanger · NGSQuality control, processing, and interpretation of Sanger and NGS data — amplicon, genome, and transcriptome projects. From chromatograms and FASTQ files to filtered variant tables, expression matrices, and biological conclusions. Контроль качества, обработка и интерпретация данных Sanger и NGS — ампликонные, геномные и транскриптомные проекты. От хроматограмм и файлов FASTQ до отфильтрованных таблиц вариантов, матриц экспрессии и биологических выводов. Sanger және NGS деректерінің сапасын бақылау, өңдеу және интерпретациялау — ампликондық, геномдық және транскриптомдық жобалар. Хроматограммалар мен FASTQ файлдарынан сүзгіден өткен варианттар кестелеріне, экспрессия матрицаларына және биологиялық қорытындыларға дейін.
Domain expertiseОтраслевая экспертизаСалалық сараптама
AppliedПрикладнаяҚолданбалыWe understand the specifics of medical, breeding and agricultural, and veterinary data — study designs, terminology, and reporting conventions — and frame the results to the expectations of the field's journals and regulators. Мы знаем специфику медицинских, селекционно-аграрных и ветеринарных данных — дизайны исследований, терминологию и требования к отчётности — и оформляем результаты в соответствии с ожиданиями профильных журналов и регуляторов. Біз медициналық, селекциялық-аграрлық және ветеринариялық деректердің ерекшелігін білеміз — зерттеу дизайндары, терминология және есептілік талаптары — және нәтижелерді салалық журналдар мен реттеуші органдардың талаптарына сай ресімдейміз.
What you receive Что вы получаете Сіз не аласыз
- Analysis report with a methods description ready for the Methods section of your manuscriptОтчёт об анализе с описанием методов, готовым для раздела Methods рукописиҚолжазбаның Methods бөліміне дайын әдістер сипаттамасы бар талдау есебі
- Publication-quality figures and tablesРисунки и таблицы публикационного качестваЖарияланым сапасындағы суреттер мен кестелер
- Processed and documented datasetsОбработанные и документированные наборы данныхӨңделген және құжатталған деректер жиынтықтары
- Scripts and pipelines on request, so the analysis can be reproducedСкрипты и пайплайны по запросу — чтобы анализ можно было воспроизвестиСұраныс бойынша скрипттер мен пайплайндар — талдауды қайталап жүргізу үшін
Data formats Форматы данных Деректер форматтары
We accept raw sequencer output (AB1 chromatograms, FASTQ files), spreadsheets, genotype tables, and phenotype databases in common formats. If your data are in an unusual format, send a small example — we will confirm whether we can work with it. Мы принимаем первичные файлы секвенаторов (хроматограммы AB1, файлы FASTQ), электронные таблицы, таблицы генотипов и базы фенотипических данных в распространённых форматах. Если данные в нестандартном формате, пришлите небольшой пример — мы подтвердим возможность работы с ним. Біз секвенаторлардың бастапқы файлдарын (AB1 хроматограммалары, FASTQ файлдары), электрондық кестелерді, генотип кестелерін және фенотиптік деректер базаларын кең таралған форматтарда қабылдаймыз. Деректеріңіз бейстандарт форматта болса, шағын мысал жіберіңіз — онымен жұмыс істеу мүмкіндігін растаймыз.
Confidentiality of your data and results is guaranteed by the contract; the data are used solely for the agreed analysis. Конфиденциальность данных и результатов гарантируется договором; данные используются исключительно для согласованного анализа. Деректер мен нәтижелердің құпиялылығына шарт кепілдік береді; деректер тек келісілген талдау үшін ғана пайдаланылады.
Order data analysis Заказать анализ данных Деректерді талдауға тапсырыс беру
Describe your study, the type and volume of your data, and the question you want to answer — we will propose an analysis plan and prepare a quote. Опишите ваше исследование, тип и объём данных и вопрос, на который нужно ответить, — мы предложим план анализа и подготовим расчёт стоимости. Зерттеуіңізді, деректердің түрі мен көлемін және жауап іздейтін сұрағыңызды сипаттаңыз — біз талдау жоспарын ұсынып, құн есебін дайындаймыз.